Το Ωνάσειο Καρδιοχειρουργικό κέντρο αντιμετωπίζει πολύ σημαντικές οικονομικές δυσκολίες οι οποίες σε συνδυασμό με την καθυστέρηση καταβολής της κρατικής επιχορήγησης εντείνουν το πρόβλημα ρευστότητας.
Οι δυσκολίες του Ωνασείου είναι γνωστές από καιρό καθώς είχε επηρρεαστεί η ροή της καταβολής της μισθοδοσίας αλλά φαίνεται ότι εντείνονται καθώς εκτός της επιχορήγησης ο ΕΟΠΥΥ χρωστά μεγάλα ποσά στο νοσηλευτικό ίδρυμα.
Οι οφειλές του ΕΟΠΥΥ προς το Ωνάσειο υπολογίζονται σε 36 εκατομμύρια ευρώ μόνο για το τρέχον έτος ενώ η κρατική επιχορήγηση, η οποία αυξάνεται διαχρονικά, υπολογίζεται σε 12 εκατομμύρια ευρώ.
Το ποσό της μισθοδοσίας είναι περίπου 34 εκατομμύρια ευρώ ετήσια. Αξίζει να σημειωθεί ότι η Διοίκηση του Ωνασείου αποδίδει μέρος των καθυστερήσεων χρηματοδότησης στις αλλαγές στα Υπουργεία.